MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 32678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	A	6	6	205	210	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
2	NC_021025	A	6	6	260	265	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
3	NC_021025	A	6	6	290	295	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
4	NC_021025	ATC	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184589
5	NC_021025	A	6	6	317	322	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
6	NC_021025	A	7	7	326	332	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
7	NC_021025	GTAA	2	8	404	411	50 %	25 %	25 %	0 %	479184589
8	NC_021025	TTTA	2	8	440	447	25 %	75 %	0 %	0 %	479184589
9	NC_021025	TTA	2	6	476	481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184589
10	NC_021025	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
11	NC_021025	AGTT	2	8	526	533	25 %	50 %	25 %	0 %	479184589
12	NC_021025	GTG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479184589
13	NC_021025	AT	3	6	570	575	50 %	50 %	0 %	0 %	479184589
14	NC_021025	A	6	6	579	584	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
15	NC_021025	AAAAT	2	10	609	618	80 %	20 %	0 %	0 %	479184589
16	NC_021025	ATG	2	6	627	632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184589
17	NC_021025	ATTA	2	8	634	641	50 %	50 %	0 %	0 %	479184589
18	NC_021025	TGA	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184589
19	NC_021025	A	6	6	672	677	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
20	NC_021025	T	6	6	689	694	0 %	100 %	0 %	0 %	479184589
21	NC_021025	TAA	2	6	703	708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184589
22	NC_021025	GTT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479184589
23	NC_021025	T	7	7	734	740	0 %	100 %	0 %	0 %	479184589
24	NC_021025	ATT	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184589
25	NC_021025	ATA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184589
26	NC_021025	ATTA	2	8	784	791	50 %	50 %	0 %	0 %	479184589
27	NC_021025	ATA	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184589
28	NC_021025	AACAGC	2	12	841	852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479184589
29	NC_021025	A	6	6	860	865	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
30	NC_021025	AATT	2	8	910	917	50 %	50 %	0 %	0 %	479184589
31	NC_021025	ATT	3	9	927	935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184589
32	NC_021025	GAT	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184589
33	NC_021025	CAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479184589
34	NC_021025	AGA	2	6	1000	1005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479184589
35	NC_021025	A	6	6	1005	1010	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
36	NC_021025	TTA	2	6	1011	1016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184589
37	NC_021025	A	7	7	1082	1088	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
38	NC_021025	GTT	2	6	1097	1102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479184589
39	NC_021025	AAGT	2	8	1150	1157	50 %	25 %	25 %	0 %	479184589
40	NC_021025	GAA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479184589
41	NC_021025	TGG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479184589
42	NC_021025	CA	3	6	1253	1258	50 %	0 %	0 %	50 %	479184589
43	NC_021025	TTA	2	6	1263	1268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184589
44	NC_021025	GAAA	2	8	1274	1281	75 %	0 %	25 %	0 %	479184589
45	NC_021025	A	7	7	1297	1303	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
46	NC_021025	A	6	6	1315	1320	100 %	0 %	0 %	0 %	479184589
47	NC_021025	GAA	2	6	1336	1341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479184589
48	NC_021025	AATA	2	8	1533	1540	75 %	25 %	0 %	0 %	479183818
49	NC_021025	TTA	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183818
50	NC_021025	AGC	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479183818
51	NC_021025	TATT	2	8	1617	1624	25 %	75 %	0 %	0 %	479183818
52	NC_021025	TTCT	2	8	1670	1677	0 %	75 %	0 %	25 %	479183818
53	NC_021025	AAT	2	6	1693	1698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183818
54	NC_021025	TTA	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183818
55	NC_021025	AAG	2	6	1770	1775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479183818
56	NC_021025	GAT	2	6	1780	1785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479183818
57	NC_021025	AATT	2	8	1820	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	479183818
58	NC_021025	AGA	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479183818
59	NC_021025	GAATT	2	10	1907	1916	40 %	40 %	20 %	0 %	479183818
60	NC_021025	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	479183818
61	NC_021025	AATG	2	8	1968	1975	50 %	25 %	25 %	0 %	479183818
62	NC_021025	ATA	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183818
63	NC_021025	A	6	6	1984	1989	100 %	0 %	0 %	0 %	479183818
64	NC_021025	TTTAAA	2	12	2004	2015	50 %	50 %	0 %	0 %	479183818
65	NC_021025	ACTA	2	8	2016	2023	50 %	25 %	0 %	25 %	479183818
66	NC_021025	T	6	6	2036	2041	0 %	100 %	0 %	0 %	479183818
67	NC_021025	CAA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479183818
68	NC_021025	TAA	3	9	2091	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183818
69	NC_021025	TTG	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479183818
70	NC_021025	AT	3	6	2196	2201	50 %	50 %	0 %	0 %	479183818
71	NC_021025	TAATT	2	10	2235	2244	40 %	60 %	0 %	0 %	479183818
72	NC_021025	CAA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479183818
73	NC_021025	TAT	2	6	2295	2300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183818
74	NC_021025	GATTT	2	10	2339	2348	20 %	60 %	20 %	0 %	479183818
75	NC_021025	GAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479183818
76	NC_021025	GAA	2	6	2443	2448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479183818
77	NC_021025	TGA	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479183818
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79	NC_021025	TAA	2	6	2589	2594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183818
80	NC_021025	ATG	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479183818
81	NC_021025	TTC	2	6	2624	2629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479183818
82	NC_021025	TTG	2	6	2711	2716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479184663
83	NC_021025	CAAA	2	8	2776	2783	75 %	0 %	0 %	25 %	479184663
84	NC_021025	TAAA	2	8	2795	2802	75 %	25 %	0 %	0 %	479184663
85	NC_021025	A	7	7	2800	2806	100 %	0 %	0 %	0 %	479184663
86	NC_021025	GAA	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479184663
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88	NC_021025	ATT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184663
89	NC_021025	A	7	7	2878	2884	100 %	0 %	0 %	0 %	479184663
90	NC_021025	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184663
91	NC_021025	ATT	2	6	2903	2908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184663
92	NC_021025	ATA	2	6	2912	2917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184663
93	NC_021025	A	6	6	2938	2943	100 %	0 %	0 %	0 %	479184663
94	NC_021025	GAT	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184663
95	NC_021025	ATAA	2	8	2950	2957	75 %	25 %	0 %	0 %	479184663
96	NC_021025	A	7	7	2965	2971	100 %	0 %	0 %	0 %	479184663
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98	NC_021025	ATT	2	6	3025	3030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184663
99	NC_021025	AAT	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184663
100	NC_021025	TA	3	6	3067	3072	50 %	50 %	0 %	0 %	479184663
101	NC_021025	TTTA	2	8	3083	3090	25 %	75 %	0 %	0 %	479184663
102	NC_021025	AATAG	2	10	3097	3106	60 %	20 %	20 %	0 %	479184663
103	NC_021025	ATA	3	9	3131	3139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184663
104	NC_021025	TGAA	2	8	3172	3179	50 %	25 %	25 %	0 %	479184663
105	NC_021025	TGA	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479184663
106	NC_021025	A	7	7	3199	3205	100 %	0 %	0 %	0 %	479184663
107	NC_021025	AAT	2	6	3215	3220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184663
108	NC_021025	A	6	6	3228	3233	100 %	0 %	0 %	0 %	479183934
109	NC_021025	ATTTAA	2	12	3259	3270	50 %	50 %	0 %	0 %	479183934
110	NC_021025	TTG	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479183934
111	NC_021025	CAAAA	2	10	3297	3306	80 %	0 %	0 %	20 %	479183934
112	NC_021025	AATT	2	8	3310	3317	50 %	50 %	0 %	0 %	479183934
113	NC_021025	ATT	2	6	3450	3455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183934
114	NC_021025	TAA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183934
115	NC_021025	A	6	6	3511	3516	100 %	0 %	0 %	0 %	479183934
116	NC_021025	TAT	2	6	3521	3526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183934
117	NC_021025	TTA	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183934
118	NC_021025	TA	3	6	3543	3548	50 %	50 %	0 %	0 %	479183934
119	NC_021025	TTTA	2	8	3560	3567	25 %	75 %	0 %	0 %	479183934
120	NC_021025	TTAC	2	8	3588	3595	25 %	50 %	0 %	25 %	479183934
121	NC_021025	AAG	2	6	3619	3624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479183934
122	NC_021025	GTA	2	6	3640	3645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479183934
123	NC_021025	AAT	2	6	3666	3671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183934
124	NC_021025	TAA	2	6	3722	3727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183934
125	NC_021025	ATT	2	6	3765	3770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183934
126	NC_021025	ATG	2	6	3808	3813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479183934
127	NC_021025	A	6	6	3816	3821	100 %	0 %	0 %	0 %	479183934
128	NC_021025	TAA	3	9	3848	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183934
129	NC_021025	AAGA	2	8	3857	3864	75 %	0 %	25 %	0 %	479183934
130	NC_021025	ATA	2	6	3883	3888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183934
131	NC_021025	CAAAA	2	10	3894	3903	80 %	0 %	0 %	20 %	479183934
132	NC_021025	AAC	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479183934
133	NC_021025	AT	3	6	3977	3982	50 %	50 %	0 %	0 %	479183934
134	NC_021025	ATT	2	6	3986	3991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479183934
135	NC_021025	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479184798
136	NC_021025	AAG	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479184798
137	NC_021025	A	7	7	4125	4131	100 %	0 %	0 %	0 %	479184798
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139	NC_021025	T	6	6	4188	4193	0 %	100 %	0 %	0 %	479184798
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